全球许多研究结论都显示，使用避孕套可以降低由HPV感染所致的生殖器疣和生殖道癌症的风险，由于HPV的易感部位除避孕套覆盖的区域外还包括阴囊、肛周等部位，发生在这些部位的HPV感染让避孕套将无法起到保护作用，所以避孕套并不能完全消除HPV感染的风险。

另外研究认为，HPV为双链DNA的小DNA病毒，球形病毒直径52~55纳米比普通避孕套乳胶分子之间的天然裂隙要小，所以使用避孕套虽然有效但却不能100%完全阻止。

有过HPV感染或宫颈病变治疗史的患者为了降低再感染或相互感染的风险, 临床上建议长期坚持使用避孕套。对这个问题, 一些患者或临床医生对于避孕套的使用在预防HPV感染、传播中的作用或价值表示怀疑,对有过HPV感染的妇女经过治疗后是否建议长期使用避孕套能降低HPV再感染的风险也存在疑惑或争议。但从以下的临床研究中提示我们,避孕套在防护HPV感染方面确实具有非常重要的作用。

虽然目前关于避孕套对HPV的屏障作用的观点不一，但是使用避孕套和减少性伴侣数是目前公认的预防性接触所致HPV感染最有效的方式。平时多运动锻炼、规律作息、补充免疫营养三种。更有关键、也较难达成的，是免疫营养的补充，食物里的营养物质在烹饪过程中会流失，进入肠胃也会被消耗掉一部分，人真正能从其中吸收到的免疫营养，尤其是硒，可以直接补充植物活性硒，能够预防癌细胞分裂和生长，抑制癌细胞的活力。