市场管理不规范造成保健品良莠不分，并营造出一个不正当竞争的保健品市场。一些正规生产的保健品没能形成规模市场，反而一些钻空子瞎炒作的保健品成为市场消费的主力。这种行业管理不规范主要表现为：

　　多层次审批权

　　国家、省、市甚至县级各级别的管理部门都可以给予批准上市的许可证，尽管国家卫生部多次强调权力收回，而且国务院也颁发了保健食品的有关法规，卫生部成立了专门的审批机构，但许多厂家及地方视若罔闻，依然我行我素。

　　审批审查条件不严格

　　多层次的审批权使得审批审查条件完全没有章法，有的地方对生产条件连看都不看就发生产合格证，审批时应进行必要的功效试验、毒理试验也成为免检项目，只要交钱或有关系。

　　广告管理混乱

　　虽然广告法已颁布多年，对保健品还有特别的规定，但对一些财大气粗的厂家似乎没有限制作用，这些厂家除了抹去“第一”等字眼，其它虚假性的内容与先前相比只有过之而无不及，并且加上了科学的皇冠。至于宣传，简直成了制造神话的武侠小说，就差直截了当地说卖大力丸了。

　　监管部门执法不严

　　许多广告、横幅、标语甚至所谓的专家义诊都有悖于相应的法规，但没有部门出现管理。有些卫生部也宣布无效的批准文号或取消的药健字号依然在市场上横行，有的干脆拿出多少年以前的批号，有的甚至没有批号。但是这些产品仍然能够在市场上存在。

　　地方保护主义泛滥

　　一旦出现问题，地方保护主义就自动站出来为当地厂家充当保护伞，让上级管理或执法部门无可奈何。